Tropa de Élite se divide entre la acción y drama, presentándonos la historia de Nascimento, el capitán de la BOPE (Batallón de Operaciones Especiales de la Policía Militar de Río de Janeiro), quien debe encargarse de un equipo para el apaciguamiento e incursiones de una de las más peligrosas favelas de Río en medio de lo que viene a ser la visita del Papa Juan Pablo II. Al mismo tiempo que transcurre su misión tiene a su esposa en los últimos días de embarazo, deseando retirarse de su arriesgado labor, para lo cual tendrá que decidir entre dos jóvenes promesas al cargo y sortear diversos riesgos diarios.